KOMPAS.com - Para ilmuwan telah mengamati SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan Covid-19, sejak awal pandemi hingga saat ini.
Dilansir dari The Guardian, (20/9/2020), mereka dapat melihat virus itu berkembang, tetapi perkembangan itu terjadi pada kecepatan glasial dibandingkan dengan dua virus lain (yang menyebabkan flu dan AIDS) dengan potensi pandemi.
Hal ini menjadi kabar baik untuk upaya mengembangkan vaksin dan perawatan, tetapi para ilmuwan tetap waspada bahwa apa pun masih bisa terjadi.
Seorang dokter penyakit menular di Universitas Sheffield dan anggota Covid-19 Genomics UK Consortium, Thushan de Silva mengatakan, virus SARS-CoV-2 berkembang.
Baca juga: Alasan Mutasi Virus D614G Tak Memengaruhi Pengembangan Vaksin Covid-19
Melacak virus mutasi "G"
Semua rangkaian genom SARS-CoV-2 disimpan di GISAID (Inisiatif Global untuk Berbagi Semua Data Influenza).
Setiap urutan berasal dari individu yang terinfeksi, dan dengan mengumpulkan serta membandingkannya, para ilmuwan dapat melacak mutasi dalam kode genetik virus dan, dalam arti tertentu, riwayat hidup SARS-CoV-2.
Diketahui, mutasi muncul melalui replikasi virus, karena dalam menggandakan dirinya sendiri virus harus menyalin kode genetiknya, dan jarang terjadi dengan sempurna.
Virus corona dinilai tidak terlalu rentan terhadap kesalahan dibandingkan virus flu, karena mereka memiliki mekanisme pemeriksaan bawaan yang lebih baik.
Meski begitu, sejak SARS-CoV-2 muncul sebagai patogen manusia, di suatu tempat di sekitar Wuhan, China, ribuan mutasi serupa telah diamati.
Sebagian besar mutasi tidak berpengaruh pada virus yang telah menginfeksi lebih dari 30 juta orang di seluruh dunia tersebut.
Mutasi dapat lenyap segera setelah muncul atau dapat menumbuhkan garis keturunan baru.
Selain itu, para ilmuwan mewaspadai mutasi yang menyebar dengan cepat, terutama jika mereka melakukannya di lokasi terpisah.
Karena mereka mungkin termasuk dalam minoritas langka yang mengubah cara virus berperilaku.
Perubahan itu dapat mendorong varian untuk mendominasi populasi virus melalui seleksi alam.
Apabila itu membuat virus lebih fit atau lebih mampu bertahan dan bereproduksi, maka itu bisa menjadi berita buruk bagi manusia.
Baca juga: LIPI Berhasil Urutkan Genom Virus Corona SARS-CoV-2, Apa Manfaatnya?
Penamaan
Sementara itu, Laboratorium Nasional Los Alamos di New Mexico, ahli biologi komputasi Bette Korber dan timnya sibuk membangun alat matematika untuk penamaan virus.
Mereka telah memiliki kandidat bahwa mutasi D614G menonjol seperti kasus pada awal April 2020.
Penamaan D614G mengacu pada gugus dalam asam amino yakni aspartat (D) ke glisin (G), pada posisi 614 dalam urutan protein yang membentuk lonjakan SARS-CoV-2.
Lonjakan adalah struktur menonjol di permukaan virus yang mengikat sel manusia, memungkinkan virus untuk masuk.
Setelah itu bereplikasi di dalam sel, keturunannya keluar lagi-membunuh sel-dan terus menginfeksi orang lain.
Sementara, saat SARS-CoV-2 muncul di Wuhan, virus ini memiliki D di posisi 614. Pada bulan Juni, G telah menggantikan D hampir di semua tempat di dunia.
Lebih mudah menular
Korber dan timnya melaporkan, temuan mereka secara resmi di jurnal Cell pada bulan Agustus, bersama dengan kesimpulan mereka bahwa peralihan tersebut telah membuat virus lebih mudah menular dan juga masih berbahaya.
Namun, sebagian besar peneliti setuju bahwa peralihan tidak berdampak pada tingkat keparahan penyakit.
Andrew Rambaut, seorang profesor evolusi molekuler di Universitas Edinburgh, menunjukkan bahwa bentuk G sudah dominan di Eropa ketika wabah berkecamuk di sana pada musim semi.
Jika tingkat kematian menurun baru-baru ini, bahkan ketika infeksi meningkat, hal itu mungkin berkaitan dengan diagnosis dan perawatan yang lebih baik.
Baca juga: Alasan Mutasi Virus D614G Tak Memengaruhi Pengembangan Vaksin Covid-19
Infeksi di Afrika
Di sisi lain, spekulasi bahwa Afrika menerima berbagai bentuk virus dari Eropa dan AS, dan bahwa ini menjelaskan mengapa infeksi di Afrika tampak pada umumnya lambat dan ringan sebagai perbandingan, tidak didukung oleh data.
Namun demikian, upaya di seluruh Afrika yang dikoordinasikan oleh Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Afrika telah menyumbangkan lebih dari 1.000 urutan genom ke GISAID pada akhir Juli 2020.
Berdasarkan hal itu, jelas bahwa semua keragaman genom yang terlihat pada SARS-CoV-2 secara global juga hadir di Afrika.
Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) melaporkan bahwa tingkat kematian akibat Covid-19 lebih rendah di Afrika daripada di bagian lain dunia.
Sulit untuk mengetahui apakah ini adalah artefak yang dihasilkan dengan menguji dan melaporkan perbedaan, tetapi jika itu nyata, itu bukan hasil evolusi virus.
Dapatkan update berita pilihan dan breaking news setiap hari dari Kompas.com. Mari bergabung di Grup Telegram "Kompas.com News Update", caranya klik link https://t.me/kompascomupdate, kemudian join. Anda harus install aplikasi Telegram terlebih dulu di ponsel.